April 28, 2024
WIELKOŚĆ NIE MA ZNACZENIA: WYBÓR MIKROBIAŁÓW DOŚWIADCZENIA ODNOSZĄ SIĘ DO ZJAWISK EKOLOGICZNYCH.

WIELKOŚĆ NIE MA ZNACZENIA: WYBÓR MIKROBIAŁÓW DOŚWIADCZENIA ODNOSZĄ SIĘ DO ZJAWISK EKOLOGICZNYCH.

Ewolucja eksperymentalna ma znaczenie dla ekologii, ponieważ może łączyć fizjologię, aw szczególności metabolizm, z zagadnieniami ekologii. Badanie związku między środowiskiem a ewolucją metabolizmu jest łatwe do prześledzenia, ponieważ eksperymenty te manipulują bardzo prostym środowiskiem w celu uzyskania przewidywalnych wyników ewolucyjnych. W ten sposób eksperymenty doboru drobnoustrojów mogą zbadać przyczynowe elementy doboru naturalnego: w jaki sposób określone cechy w różnych środowiskach przyniosą różne dopasowanie.

W tym miejscu dokonujemy przeglądu metodologii eksperymentów ewolucji drobnoustrojów i zajmujemy się trzema kwestiami, które są istotne dla ekologów: interakcje genotypów ze środowiskiem, zróżnicowanie ekologiczne ze względu na specjalizację oraz negatywna selekcja zależna od częstotliwości. Po pierwsze, spodziewamy się, że interakcje genotypów ze środowiskiem będą wszechobecne w systemach biologicznych. Po drugie, chociaż w niektórych przypadkach ekologicznej specjalizacji uwikłana jest antagonistyczna plejotropia, wydaje się, że działają również inne mechanizmy.

Po trzecie, podczas gdy negatywna selekcja zależna od częstotliwości może utrzymać różnorodność ekologiczną w systemach laboratoryjnych, analiza mechanistyczna (biochemiczna) tych systemów sugeruje, że ujemna zależność od częstotliwości może mieć zastosowanie tylko w wąskim zakresie środowisk, jeśli zasoby są substytucyjne. Na koniec dochodzimy do wniosku, że ewolucja eksperymentalna drobnoustrojów musi korzystać z technik molekularnych, które mogłyby umożliwić mechanistyczne zrozumienie zróżnicowania ekologicznego w tych prostych systemach.

Miękka zgnilizna Enterobacteriaceae (SRE) gatunki Pectobacterium i Dickeya (wcześniej klasyfikowane jako pektynolityczne Erwinia spp.) Powodują poważne choroby ziemniaka i innych roślin uprawnych i ogrodniczych. Mogą wpływać na rosnącą roślinę ziemniaka, powodując czarną nóżkę i są odpowiedzialne za miękką zgniliznę bulw podczas przechowywania, zmniejszając w ten sposób plon i jakość. Wydajne i opłacalne metody wykrywania i identyfikacji są niezbędne do badania ekologii i patogenezy SRE, a także do programów certyfikacji nasion. Celem tego przeglądu było zebranie wszystkich istniejących informacji na temat dostępnych metod wykrywania SRE.

Raport przeglądowy dotyczy pobierania próbek i przygotowania materiału roślinnego do badań oraz ponad trzydziestu metod wykrywania, identyfikacji i różnicowania miękkiej zgnilizny i czarnej nóżki wywołującej bakterie na poziomie gatunku i podgatunku. Należą do nich metody oparte na cechach biochemicznych, serologii, techniki molekularne polegające na amplifikacji sekwencji DNA, a także kilka mniej zbadanych. Bakterie żyjące w osadach przyujściowych i przybrzeżnych będą jednymi z pierwszych celów tych nowych zanieczyszczeń. Pseudomonady często występują w tych ekosystemach. Biorą udział w kilku cyklach biogeochemicznych i są znane ze swojej wysokiej odporności na zanieczyszczenia.

W konsekwencji to badanie skupiające się na wpływie CdSe NP na morski szczep P. fluorescens BA3SM1 jest bardzo istotne z kilku powodów. Po pierwsze, ma na celu poprawę wiedzy na temat interakcji między bakteriami a nanocząsteczkami. Ma to fundamentalne znaczenie dla skutecznego wykorzystania NP przeciwko chorobotwórczym bakteriom. Po drugie, pomimo interakcji CdSe NP z komórkami bakteryjnymi, szczep BA3SM1 może opracować różne strategie przeciwdziałania toksyczności CdSe NP i zapewnienia jego wzrostu. Wykazuje interesujące właściwości sekwestrowania NP CdSe i zachowuje zdolność do tworzenia biofilmu. Dlatego szczep ten wydaje się być obiecującym czynnikiem w bioremediacji NP dzięki procesom biofiltracji.

Wreszcie badanie pokazuje, że nanocząsteczki CdSe o średnicy 8 nm powodują zmniejszenie wydzielania sideroforu pyoverdine, wtórnego metabolitu odgrywającego kluczową rolę w ekologii drobnoustrojów, ponieważ napędza on przetrwanie bakterii i konkurencyjność w ekosystemach. Bakterie wytwarzające efektywne siderofory przeżywają lepiej w środowisku z niedoborem Fe, gdzie antagonizują wzrost innych drobnoustrojów, które uważają za niedobór żelaza. Ponadto siderofory są również wykorzystywane jako czynniki wirulencji w ludzkich szczepach patogennych, takich jak P. aeruginosa.

W związku z tym badanie podkreśla, że ​​nanocząsteczki mogą wpływać na wtórny metabolizm bakterii, co ma konsekwencje środowiskowe i medyczne. Ponadto w tej pracy pozyskiwanie danych zależne od danych (DDA) zapewniło najnowocześniejsze dane ze spektrometrii masowej za pomocą Spectral Counting i MS1 Label-Free. Połączenie tych dwóch dobrze znanych technik proteomicznych, w tym walidacji ręcznej, wzmocniło identyfikację i oznaczanie ilościowe regulowanych białek. Ponadto liczne korelacje między analizami proteomicznymi a innymi obserwacjami (fizjologicznymi, biochemicznymi, mikroskopowymi) ugruntowały nasze interpretacje.

WIELKOŚĆ NIE MA ZNACZENIA: WYBÓR MIKROBIAŁÓW DOŚWIADCZENIA ODNOSZĄ SIĘ DO ZJAWISK EKOLOGICZNYCH.

Profile proteomiczne i metabolomiczne wykazują zróżnicowanie wśród wolno żyjących i symbiotycznych biofilmów vibrio fischeri.

Wiele gatunków bakterii może rosnąć w różnych trybach historii życia, co umożliwia ich przetrwanie i przetrwanie zarówno w stadiach wolnego życia planktonu, jak i w społecznościach biofilmu. Mechanizmy przyczyniające się do trwałości i przeżycia komórki planktonowej lub biofilmu można dokładnie określić przy użyciu wielu technik różnicujących (np. Genomika i transkryptomika). W tym badaniu przedstawiamy analizy proteomiczne i metabolomiczne biofilmów Vibrio fischeri, wykazujące potencjał połączonych badań różnicowych w celu wyjaśnienia zmian w historii życia ważnych dla ustalenia mutualizmu poprzez tworzenie biofilmu i kolonizację gospodarza.

W badaniu wykorzystano podejście metabolomiczne / proteomiczne lub „metaproteomiczne”, odnoszące się do połączonej analizy białek i danych metabolicznych, która wypełnia lukę między zmianami fenotypowymi (tworzenie się komórek planktonowych w biofilmie) a zmianami genotypowymi (odzwierciedlonymi w profilach białek / metabolicznych). Nasze metody wykorzystywały konstrukcję strzelby białkowej, a następnie chromatografię cieczową połączoną z wykrywaniem spektrometrii mas (LC-MS) i oznaczaniem ilościowym zarówno dla organizmów wolno żyjących, jak i tworzących biofilm V. fischeri.

Adenovirus IgM

DEADVM0010 96
EUR 92

Adenovirus E1A

PC-054 Polyclonal Ask for price

Fowl Adenovirus

PCR-V040-PCRV04048D PCR-V040-48D
EUR 230

Fowl Adenovirus

PCR-V040-PCRV04096D PCR-V040-96D
EUR 312

Fowl Adenovirus

Oneq-V040-OneqV040100D Oneq-V040-100D
EUR 515

Fowl Adenovirus

Oneq-V040-OneqV040150D Oneq-V040-150D
EUR 594

Fowl Adenovirus

Oneq-V040-OneqV04050D Oneq-V040-50D
EUR 413

Mouse Adenovirus

PCR-V366-PCRV36648D PCR-V366-48D
EUR 230

Mouse Adenovirus

PCR-V366-PCRV36696D PCR-V366-96D
EUR 312

Mouse Adenovirus

Oneq-V366-OneqV366100D Oneq-V366-100D
EUR 515

Mouse Adenovirus

Oneq-V366-OneqV366150D Oneq-V366-150D
EUR 594

Mouse Adenovirus

Oneq-V366-OneqV36650D Oneq-V366-50D
EUR 413

Falcon adenovirus

PCR-V017-PCRV01748D PCR-V017-48D
EUR 230

Falcon adenovirus

PCR-V017-PCRV01796D PCR-V017-96D
EUR 312

Reptil Adenovirus

PCR-V308-PCRV30848D PCR-V308-48D
EUR 230

Reptil Adenovirus

PCR-V308-PCRV30896D PCR-V308-96D
EUR 312

Reptil Adenovirus

Oneq-V308-OneqV308100D Oneq-V308-100D
EUR 515

Reptil Adenovirus

Oneq-V308-OneqV308150D Oneq-V308-150D
EUR 594

Reptil Adenovirus

Oneq-V308-OneqV30850D Oneq-V308-50D
EUR 413

Falcon adenovirus

Oneq-V017-OneqV017100D Oneq-V017-100D
EUR 515

Falcon adenovirus

Oneq-V017-OneqV017150D Oneq-V017-150D
EUR 594

Falcon adenovirus

Oneq-V017-OneqV01750D Oneq-V017-50D
EUR 413

Adenovirus protein

30R-AA006X 100 ug
EUR 954
Description: Purified native Adenovirus protein

Adenovirus antibody

10-3147 1 mg
EUR 430.8
Description: Mouse Monoclonal Adenovirus antibody

Adenovirus antibody

10-3148 1 mg
EUR 430.8
Description: Mouse Monoclonal Adenovirus antibody

Adenovirus antibody

10-A02A 200 ug
EUR 424.8
Description: Mouse monoclonal Adenovirus antibody

Adenovirus antibody

10-A02B 200 ug
EUR 337.2
Description: Mouse monoclonal Adenovirus antibody

Adenovirus antibody

10-A02C 200 ug
EUR 273.6
Description: Mouse monoclonal Adenovirus antibody

Adenovirus antibody

10-A02E 1 mg
EUR 636
Description: Mouse monoclonal Adenovirus antibody

Adenovirus antibody

10-A02F 200 ug
EUR 268.8
Description: Mouse monoclonal Adenovirus antibody

Adenovirus antibody

10-A02G 200 ug
EUR 424.8
Description: Mouse monoclonal Adenovirus antibody

Adenovirus antibody

10-A02H 200 ug
EUR 482.4
Description: Mouse monoclonal Adenovirus antibody

Adenovirus antibody

10C-CR1238M2 100 ug
EUR 296.4
Description: Mouse monoclonal Adenovirus antibody

Adenovirus antibody

10R-A115a 1 mg
EUR 489.6
Description: Mouse monoclonal Adenovirus antibody

Adenovirus antibody

10R-A115b 1 mg
EUR 586.8
Description: Mouse monoclonal Adenovirus antibody

Adenovirus antibody

10R-A115c 1 mg
EUR 537.6
Description: Mouse monoclonal Adenovirus antibody

Adenovirus antibody

20-AG02 1 mg
EUR 139.2
Description: Goat polyclonal Adenovirus antibody

Adenovirus antibody

70R-AR025 100 ug
EUR 360
Description: Affinity purified Rabbit polyclonal Adenovirus antibody

Adenovirus Antibody

abx021507-1mg 1 mg
EUR 961.2

Adenovirus Antibody

abx021509-1mg 1 mg
EUR 1111.2

Adenovirus Antibody

abx021510-1mg 1 mg
EUR 710.4

Adenovirus Antibody

abx021511-1mg 1 mg
EUR 710.4

Adenovirus Antibody

abx021512-1mg 1 mg
EUR 710.4

Adenovirus Antibody

abx021521-02mg 0.2 mg
EUR 1345.2

Adenovirus Antibody

abx021524-1mg 1 mg
EUR 1220.4

Adenovirus Antibody

abx022913-1ml 1 ml
EUR 718.8

Adenovirus PCR kit

PCR-H501-48D 50T
EUR 543.6

Adenovirus PCR kit

PCR-H501-96D 100T
EUR 686.4

Fowl Adenovirus 4

PCR-V041-PCRV04148D PCR-V041-48D
EUR 230

Fowl Adenovirus 4

PCR-V041-PCRV04196D PCR-V041-96D
EUR 312

Fowl Adenovirus 4

Oneq-V041-OneqV041100D Oneq-V041-100D
EUR 515

Fowl Adenovirus 4

Oneq-V041-OneqV041150D Oneq-V041-150D
EUR 594

Fowl Adenovirus 4

Oneq-V041-OneqV04150D Oneq-V041-50D
EUR 413

Adeno-SV40 Adenovirus

G210 250 ul
EUR 1216.8

Sox2 Adenovirus (Human)

000691A 750 μl
EUR 375

Adenovirus Rapid Test

IAD-N602 1 kit Ask for price

Adenovirus RT PCR kit

RTq-H501-100D 100T
EUR 860.4

Adenovirus RT PCR kit

RTq-H501-150D 150T
EUR 969.6

Adenovirus RT PCR kit

RTq-H501-50D 50T
EUR 717.6

Adenovirus (ADV) Antibody

abx411041-1ml 1 ml
EUR 610.8

Adenovirus E1A antibody

20-ES02 100 ug
EUR 262.8
Description: Sheep polyclonal Adenovirus E1A antibody

CRISPR / hCas9 Adenovirus

AVP010 1x109 IFU/ml x 200ul
EUR 541.2
Description: pre-made adenovirus expresses the neclear penetrated, human codon optimized wild-type Cas9 endonuclease, provided in DMEM medium.

Adenovirus (ADV) Antibody

abx414317-1ml 1 ml
EUR 794.4

Adenovirus (ADV) Antibody

abx414953-1mg 1 mg
EUR 994.8

Adenovirus antibody (HRP)

60-A02 1 ml
EUR 494.4
Description: Goat polyclonal Adenovirus antibody (HRP) conjugated

Cas9 Nickase Adenovirus

K007 1.0 ml, 10^6 pfu/ml, Titer: 10^6 pfu/ml
EUR 315
Description: N/A

Adenovirus protein (Mouse)

30-1268 1 mg
EUR 289.2
Description: Purified native Adenovirus protein (Mouse)

Adenovirus Antibody (FITC)

abx021508-1mg 1 mg
EUR 1496.4

Adenovirus Antibody (FITC)

abx022914-1ml 1 ml
EUR 777.6

Adenovirus antibody (FITC)

61-A02A 100 ug
EUR 429.6
Description: Mouse monoclonal Adenovirus antibody (FITC)

Adenovirus antibody (FITC)

60-A01 1 ml
EUR 440.4
Description: Goat polyclonal Adenovirus antibody (FITC) conjugated

Adenovirus antibody (FITC)

60C-CR1238GF 1 ml
EUR 435.6
Description: Goat polyclonal Adenovirus antibody (FITC) conjugated

Cas9 Nuclease Adenovirus

K004 1.0 ml, 10^6 pfu/ml, Titer: 10^6 pfu/ml
EUR 315
Description: N/A

Fowl Adenovirus PCR kit

PCR-V040-48D 50T
EUR 543.6

Fowl Adenovirus PCR kit

PCR-V040-96D 100T
EUR 686.4

Adenovirus Hexon Antibody

abx120000-1mg 1 mg
EUR 718.8

Adenovirus Hexon Antibody

abx120001-1mg 1 mg
EUR 718.8

Adenovirus Hexon Antibody

abx120002-1mg 1 mg
EUR 718.8

Adenovirus Hexon Antibody

abx120003-1mg 1 mg
EUR 718.8

Adenovirus Hexon Antibody

abx120004-1mg 1 mg
EUR 718.8

Adenovirus Hexon Antibody

abx120005-1mg 1 mg
EUR 718.8

Adenovirus Hexon Antibody

abx120006-1mg 1 mg
EUR 718.8

Adenovirus Hexon Antibody

abx120007-1mg 1 mg
EUR 718.8

Adenovirus Hexon Antibody

abx021514-1mg 1 mg
EUR 1011.6

Adenovirus Hexon Antibody

abx021516-1mg 1 mg
EUR 1011.6

Adenovirus Hexon Antibody

abx021518-1mg 1 mg
EUR 1220.4

Adenovirus Hexon Antibody

abx021519-1mg 1 mg
EUR 1111.2

Adenovirus Hexon Antibody

abx021520-1mg 1 mg
EUR 878.4

Adenovirus Hexon Antibody

abx021523-1mg 1 mg
EUR 878.4

Adenovirus Hexon Antibody

abx021525-1mg 1 mg
EUR 878.4

Adenovirus Hexon Antibody

abx023633-1mg 1 mg
EUR 794.4

Adenovirus Hexon Antibody

abx023661-1mg 1 mg
EUR 718.8

Adenovirus Hexon Antibody

abx023662-1mg 1 mg
EUR 718.8

Adenovirus Hexon Antibody

abx023854-1mg 1 mg
EUR 718.8

Adenovirus Hexon Antibody

abx023856-1mg 1 mg
EUR 718.8

Adenovirus Hexon Antibody

abx023857-1mg 1 mg
EUR 718.8

Adenovirus Hexon Antibody

abx023858-1mg 1 mg
EUR 718.8

Adenovirus Hexon Antibody

abx023872-1mg 1 mg
EUR 718.8

Adenovirus Hexon Antibody

abx024001-1mg 1 mg
EUR 1212

Adenovirus Hexon Antibody

abx024002-1mg 1 mg
EUR 1212

Adenovirus Hexon Antibody

abx024003-1mg 1 mg
EUR 1212

RFP expression Adenovirus

AVP001 1x109 IFU/ml x 200ul
EUR 418.8
Description: pre-made RFP expression adenovirus, provided in DMEM medium.

CFP expression Adenovirus

AVP002 1x109 IFU/ml x 200ul
EUR 418.8
Description: pre-made CFP expression adenovirus, provided in DMEM medium.

Luciferase / GFP Adenovirus

AVP004 1x109 IFU/ml x 200ul
EUR 418.8
Description: pre-made Luciferase / GFP expression adenovirus, provided in DMEM medium.

Luciferase / RFP Adenovirus

AVP005 1x109 IFU/ml x 200ul
EUR 418.8
Description: pre-made Luciferase / RFP expression adenovirus, provided in DMEM medium.

GFP expression Adenovirus

AVP011 1x109 IFU/ml x 200ul
EUR 418.8
Description: pre-made GFP expression adenovirus, provided in DMEM medium.

YFP expression Adenovirus

AVP012 1x109 IFU/ml x 200ul
EUR 418.8
Description: pre-made YFP expression adenovirus, provided in DMEM medium.

BFP expression Adenovirus

AVP017 1x109 IFU/ml x 200ul
EUR 418.8
Description: pre-made BFP expression adenovirus, provided in DMEM medium.

Adenovirus IgA ELISA kit

55R-IB79201 96 wells
EUR 379.2
Description: ELISA kit for the detection of Adenovirus IgA in the research laboratory

Adenovirus IgG ELISA kit

55R-IB79202 96 wells
EUR 396
Description: ELISA kit for the detection of Adenovirus IgG in the research laboratory

Adenovirus IgM ELISA kit

55R-IB79203 96 wells
EUR 382.8
Description: ELISA kit for the detection of Adenovirus IgM in the research laboratory

Adenovirus IgG ELISA Kit

DEIA309 96T
EUR 780
Description: The Adenovirus IgG Antibody ELISA Test Kit has been designed for the the detection and the quantitative determination of specific IgG antibodies against Adenovirus in serum and plasma.

Adenovirus IgA ELISA Kit

DEIA310 96T
EUR 780
Description: The Adenovirus IgA Antibody ELISA Test Kit has been designed for the the detection and the quantitative determination of specific IgA antibodies against Adenovirus in serum and plasma.

Adenovirus IgM ELISA Kit

DEIA311 96T
EUR 780
Description: The Adenovirus IgM Antibody ELISA Test Kit has been designed forthe the detection and the quantitative determination of specific IgM antibodies against Adenovirus in serum and plasma.

Mouse Adenovirus PCR kit

PCR-V366-48D 50T
EUR 543.6

Mouse Adenovirus PCR kit

PCR-V366-96D 100T
EUR 686.4

Adenovirus Type 2 Hexon

BA128VS 1 mg
EUR 803

GFP Recombinant Adenovirus

ADV-004 50 ?L
EUR 1069.2
Description: Premade recombinant adenovirus containing the GFP gene

Cre Recombinant Adenovirus

ADV-005 50 ?L
EUR 1069.2
Description: Premade recombinant adenovirus containing the Cre gene

Adenovirus antibody (biotin)

60C-CR1238GB 1 ml
EUR 435.6
Description: Goat polyclonal Adenovirus antibody (biotin) conjugated

Adenovirus 40 & 41 Antibody

abx021513-1mg 1 mg
EUR 710.4

Falcon adenovirus PCR kit

PCR-V017-48D 50T
EUR 543.6

Falcon adenovirus PCR kit

PCR-V017-96D 100T
EUR 686.4

Reptil Adenovirus PCR kit

PCR-V308-48D 50T
EUR 543.6

Reptil Adenovirus PCR kit

PCR-V308-96D 100T
EUR 686.4

Canine adenovirus type 1

PCR-V077-PCRV07748D PCR-V077-48D
EUR 230

Canine adenovirus type 1

PCR-V077-PCRV07796D PCR-V077-96D
EUR 312

Canine adenovirus type 2

PCR-V078-PCRV07848D PCR-V078-48D
EUR 230

Canine adenovirus type 2

PCR-V078-PCRV07896D PCR-V078-96D
EUR 312

Canine adenovirus type 1

Oneq-V077-OneqV077100D Oneq-V077-100D
EUR 515

Canine adenovirus type 1

Oneq-V077-OneqV077150D Oneq-V077-150D
EUR 594

Canine adenovirus type 1

Oneq-V077-OneqV07750D Oneq-V077-50D
EUR 413

Przedstawiamy obraz z rozdzielczością czasową około 100 białek (2D-PAGE i proteomika strzelby) i 200 metabolitów, które są obecne podczas przejścia od wzrostu planktonu do tworzenia biofilmu w społeczności. Białka biorące udział w odpowiedzi na stres, naprawie uszkodzeń DNA i transporcie okazały się silnie wyrażane w stanie biofilmu. Ponadto metabolity wykryte w biofilmach odpowiadają składnikom macierzy egzopolisacharydów (EPS) (cukry i glicerol). Zmianom enzymów metabolicznych towarzyszyły wyraźniejsze zmiany stężenia półproduktów ze szlaku glikolizy, a także kilku aminokwasów.