enzymes for adhesions

Ewolucja eksperymentalna ma znaczenie dla ekologii, ponieważ może łączyć fizjologię, aw szczególności metabolizm, z zagadnieniami ekologii. Badanie związku między środowiskiem a ewolucją metabolizmu jest łatwe do prześledzenia, ponieważ eksperymenty te manipulują bardzo prostym środowiskiem w celu uzyskania przewidywalnych wyników ewolucyjnych. W ten sposób eksperymenty doboru drobnoustrojów mogą zbadać przyczynowe elementy doboru naturalnego: w jaki sposób określone cechy w różnych środowiskach przyniosą różne dopasowanie.

W tym miejscu dokonujemy przeglądu metodologii eksperymentów ewolucji drobnoustrojów i zajmujemy się trzema kwestiami, które są istotne dla ekologów: interakcje genotypów ze środowiskiem, zróżnicowanie ekologiczne ze względu na specjalizację oraz negatywna selekcja zależna od częstotliwości. Po pierwsze, spodziewamy się, że interakcje genotypów ze środowiskiem będą wszechobecne w systemach biologicznych. Po drugie, chociaż w niektórych przypadkach ekologicznej specjalizacji uwikłana jest antagonistyczna plejotropia, wydaje się, że działają również inne mechanizmy.

Po trzecie, podczas gdy negatywna selekcja zależna od częstotliwości może utrzymać różnorodność ekologiczną w systemach laboratoryjnych, analiza mechanistyczna (biochemiczna) tych systemów sugeruje, że ujemna zależność od częstotliwości może mieć zastosowanie tylko w wąskim zakresie środowisk, jeśli zasoby są substytucyjne. Na koniec dochodzimy do wniosku, że ewolucja eksperymentalna drobnoustrojów musi korzystać z technik molekularnych, które mogłyby umożliwić mechanistyczne zrozumienie zróżnicowania ekologicznego w tych prostych systemach.

Miękka zgnilizna Enterobacteriaceae (SRE) gatunki Pectobacterium i Dickeya (wcześniej klasyfikowane jako pektynolityczne Erwinia spp.) Powodują poważne choroby ziemniaka i innych roślin uprawnych i ogrodniczych. Mogą wpływać na rosnącą roślinę ziemniaka, powodując czarną nóżkę i są odpowiedzialne za miękką zgniliznę bulw podczas przechowywania, zmniejszając w ten sposób plon i jakość. Wydajne i opłacalne metody wykrywania i identyfikacji są niezbędne do badania ekologii i patogenezy SRE, a także do programów certyfikacji nasion. Celem tego przeglądu było zebranie wszystkich istniejących informacji na temat dostępnych metod wykrywania SRE.

Raport przeglądowy dotyczy pobierania próbek i przygotowania materiału roślinnego do badań oraz ponad trzydziestu metod wykrywania, identyfikacji i różnicowania miękkiej zgnilizny i czarnej nóżki wywołującej bakterie na poziomie gatunku i podgatunku. Należą do nich metody oparte na cechach biochemicznych, serologii, techniki molekularne polegające na amplifikacji sekwencji DNA, a także kilka mniej zbadanych. Bakterie żyjące w osadach przyujściowych i przybrzeżnych będą jednymi z pierwszych celów tych nowych zanieczyszczeń. Pseudomonady często występują w tych ekosystemach. Biorą udział w kilku cyklach biogeochemicznych i są znane ze swojej wysokiej odporności na zanieczyszczenia.

W konsekwencji to badanie skupiające się na wpływie CdSe NP na morski szczep P. fluorescens BA3SM1 jest bardzo istotne z kilku powodów. Po pierwsze, ma na celu poprawę wiedzy na temat interakcji między bakteriami a nanocząsteczkami. Ma to fundamentalne znaczenie dla skutecznego wykorzystania NP przeciwko chorobotwórczym bakteriom. Po drugie, pomimo interakcji CdSe NP z komórkami bakteryjnymi, szczep BA3SM1 może opracować różne strategie przeciwdziałania toksyczności CdSe NP i zapewnienia jego wzrostu. Wykazuje interesujące właściwości sekwestrowania NP CdSe i zachowuje zdolność do tworzenia biofilmu. Dlatego szczep ten wydaje się być obiecującym czynnikiem w bioremediacji NP dzięki procesom biofiltracji.

Wreszcie badanie pokazuje, że nanocząsteczki CdSe o średnicy 8 nm powodują zmniejszenie wydzielania sideroforu pyoverdine, wtórnego metabolitu odgrywającego kluczową rolę w ekologii drobnoustrojów, ponieważ napędza on przetrwanie bakterii i konkurencyjność w ekosystemach. Bakterie wytwarzające efektywne siderofory przeżywają lepiej w środowisku z niedoborem Fe, gdzie antagonizują wzrost innych drobnoustrojów, które uważają za niedobór żelaza. Ponadto siderofory są również wykorzystywane jako czynniki wirulencji w ludzkich szczepach patogennych, takich jak P. aeruginosa.

W związku z tym badanie podkreśla, że ​​nanocząsteczki mogą wpływać na wtórny metabolizm bakterii, co ma konsekwencje środowiskowe i medyczne. Ponadto w tej pracy pozyskiwanie danych zależne od danych (DDA) zapewniło najnowocześniejsze dane ze spektrometrii masowej za pomocą Spectral Counting i MS1 Label-Free. Połączenie tych dwóch dobrze znanych technik proteomicznych, w tym walidacji ręcznej, wzmocniło identyfikację i oznaczanie ilościowe regulowanych białek. Ponadto liczne korelacje między analizami proteomicznymi a innymi obserwacjami (fizjologicznymi, biochemicznymi, mikroskopowymi) ugruntowały nasze interpretacje.

Profile proteomiczne i metabolomiczne wykazują zróżnicowanie wśród wolno żyjących i symbiotycznych biofilmów vibrio fischeri.

Wiele gatunków bakterii może rosnąć w różnych trybach historii życia, co umożliwia ich przetrwanie i przetrwanie zarówno w stadiach wolnego życia planktonu, jak i w społecznościach biofilmu. Mechanizmy przyczyniające się do trwałości i przeżycia komórki planktonowej lub biofilmu można dokładnie określić przy użyciu wielu technik różnicujących (np. Genomika i transkryptomika). W tym badaniu przedstawiamy analizy proteomiczne i metabolomiczne biofilmów Vibrio fischeri, wykazujące potencjał połączonych badań różnicowych w celu wyjaśnienia zmian w historii życia ważnych dla ustalenia mutualizmu poprzez tworzenie biofilmu i kolonizację gospodarza.

W badaniu wykorzystano podejście metabolomiczne / proteomiczne lub „metaproteomiczne”, odnoszące się do połączonej analizy białek i danych metabolicznych, która wypełnia lukę między zmianami fenotypowymi (tworzenie się komórek planktonowych w biofilmie) a zmianami genotypowymi (odzwierciedlonymi w profilach białek / metabolicznych). Nasze metody wykorzystywały konstrukcję strzelby białkowej, a następnie chromatografię cieczową połączoną z wykrywaniem spektrometrii mas (LC-MS) i oznaczaniem ilościowym zarówno dla organizmów wolno żyjących, jak i tworzących biofilm V. fischeri.

Scrambled 10Panx
A2701-25	ApexBio	25 mg	EUR 514
Description: Scrambled 10Panx is the scrambled form of 10Panx (WRQAAFVDSY), a mimetic peptide of pannexin 1 that inhibits dye uptake by macrophages without affecting cellular membrane currents.

Scrambled 10Panx
A2701-5	ApexBio	5 mg	EUR 166
Description: Scrambled 10Panx is the scrambled form of 10Panx (WRQAAFVDSY), a mimetic peptide of pannexin 1 that inhibits dye uptake by macrophages without affecting cellular membrane currents.

Scrambled TRAP Fragment
5-01910	CHI Scientific	4 x 5mg	Ask for price

Neuropeptide Y (scrambled)
B7530-1	ApexBio	1 mg	EUR 405
Description: Scrambled Neuropeptide Y (scNPY) was similarly synthesized and contains the same amino acids as NPY, but scNPY is in a random sequence, it was used as a control in the research in NPY [1]. The sequence of scNPY is SKPQRDANREPTRYAIYDYSNPDIELHYLRPAYALG-NH2 [2].

LL-37 (scrambled)
H-7886.0500	Bachem	0.5mg	EUR 283
Description: Sum Formula: C205H340N60O53; CAS# [1354065-56-7] net

LL-37 (scrambled)
H-7886.1000	Bachem	1.0mg	EUR 441
Description: Sum Formula: C205H340N60O53; CAS# [1354065-56-7] net

Scrambled TRAP Fragment Peptide
20-abx265858	Abbexa	EUR 356.00 EUR 537.00 EUR 286.00	10 mg 25 mg 5 mg
Shipped within 5-10 working days.

LL-37 scrambled peptide
HY-P1513	MedChemExpress	1mg	EUR 349

Scrambled sgRNA CRISPR Lentivector
K018	ABM	1.0 ug	EUR 154

5-FAM-LL-37 (scrambled)
H-7888.0500	Bachem	0.5mg	EUR 466
Description: Sum Formula: C226H350N60O59; CAS# [2022972-73-0] net

5-FAM-LL-37 (scrambled)
H-7888.1000	Bachem	1.0mg	EUR 776
Description: Sum Formula: C226H350N60O59; CAS# [2022972-73-0] net

Biotinyl-eAhx-LL-37 (scrambled)
H-7896.0500	Bachem	0.5mg	EUR 452
Description: Sum Formula: C221H365N63O56S; CAS# [2022972-72-9] net

Biotinyl-eAhx-LL-37 (scrambled)
H-7896.1000	Bachem	1.0mg	EUR 747
Description: Sum Formula: C221H365N63O56S; CAS# [2022972-72-9] net

Tet-pLKO-Puro-Scrambled Plasmid
PVT14797	Lifescience Market	2 ug	EUR 370

Adenovirus protein
30R-AA006X	Fitzgerald	100 ug	EUR 795
Description: Purified native Adenovirus protein

Adenovirus antibody
10C-CR1238M2	Fitzgerald	100 ug	EUR 247
Description: Mouse monoclonal Adenovirus antibody

Adenovirus antibody
10-3147	Fitzgerald	1 mg	EUR 359
Description: Mouse Monoclonal Adenovirus antibody

Adenovirus antibody
10-3148	Fitzgerald	1 mg	EUR 359
Description: Mouse Monoclonal Adenovirus antibody

Adenovirus antibody
10-A02A	Fitzgerald	200 ug	EUR 354
Description: Mouse monoclonal Adenovirus antibody

Adenovirus antibody
10-A02B	Fitzgerald	200 ug	EUR 281
Description: Mouse monoclonal Adenovirus antibody

Adenovirus antibody
10-A02C	Fitzgerald	200 ug	EUR 228
Description: Mouse monoclonal Adenovirus antibody

Adenovirus antibody
10-A02E	Fitzgerald	1 mg	EUR 530
Description: Mouse monoclonal Adenovirus antibody

Adenovirus antibody
10-A02F	Fitzgerald	200 ug	EUR 224
Description: Mouse monoclonal Adenovirus antibody

Adenovirus antibody
10-A02G	Fitzgerald	200 ug	EUR 354
Description: Mouse monoclonal Adenovirus antibody

Adenovirus antibody
10-A02H	Fitzgerald	200 ug	EUR 402
Description: Mouse monoclonal Adenovirus antibody

Adenovirus antibody
20-AG02	Fitzgerald	1 mg	EUR 116
Description: Goat polyclonal Adenovirus antibody

Adenovirus antibody
10R-A115a	Fitzgerald	1 mg	EUR 408
Description: Mouse monoclonal Adenovirus antibody

Adenovirus antibody
10R-A115b	Fitzgerald	1 mg	EUR 489
Description: Mouse monoclonal Adenovirus antibody

Adenovirus antibody
10R-A115c	Fitzgerald	1 mg	EUR 448
Description: Mouse monoclonal Adenovirus antibody

Adenovirus antibody
70R-AR025	Fitzgerald	100 ug	EUR 300
Description: Affinity purified Rabbit polyclonal Adenovirus antibody

Adenovirus Antibody
abx022913-1ml	Abbexa	1 ml	EUR 599
Shipped within 5-10 working days.

Adenovirus Antibody
abx021507-1mg	Abbexa	1 mg	EUR 801
Shipped within 5-10 working days.

Adenovirus Antibody
abx021509-1mg	Abbexa	1 mg	EUR 926
Shipped within 5-10 working days.

Adenovirus Antibody
abx021510-1mg	Abbexa	1 mg	EUR 592
Shipped within 5-10 working days.

Adenovirus Antibody
abx021511-1mg	Abbexa	1 mg	EUR 592
Shipped within 5-10 working days.

Adenovirus Antibody
abx021512-1mg	Abbexa	1 mg	EUR 592
Shipped within 5-10 working days.

Adenovirus Antibody
abx021521-02mg	Abbexa	0.2 mg	EUR 1121
Shipped within 5-10 working days.

Adenovirus Antibody
abx021524-1mg	Abbexa	1 mg	EUR 1017
Shipped within 5-10 working days.

3-D Life Scrambled RGD Peptide
09-P-003	Cellendes	1 µmol	EUR 121

Amyloid b-Protein (1-42) (scrambled)
H-7406.0500	Bachem	0.5mg	EUR 441
Description: Sum Formula: C203H311N55O60S; CAS# [1678415-52-5] net

Amyloid b-Protein (1-42) (scrambled)
H-7406.1000	Bachem	1.0mg	EUR 589
Description: Sum Formula: C203H311N55O60S; CAS# [1678415-52-5] net

Amyloid b-Protein (1-40) (scrambled)
H-7408.0500	Bachem	0.5mg	EUR 335
Description: Sum Formula: C194H295N53O58S; CAS# [1678415-68-3] net

Amyloid b-Protein (1-40) (scrambled)
H-7408.1000	Bachem	1.0mg	EUR 606
Description: Sum Formula: C194H295N53O58S; CAS# [1678415-68-3] net

Tide Fluor 2-LL-37 (scrambled)
H-8288.0100	Bachem	0.1mg	EUR 312
Description: Sum Formula: C205H340N60O53+dye

Tide Fluor 2-LL-37 (scrambled)
H-8288.0500	Bachem	0.5mg	EUR 1017
Description: Sum Formula: C205H340N60O53+dye

Prion Protein (106-126) (human) (scrambled)
H-4882.0500	Bachem	0.5mg	EUR 273
Description: Sum Formula: C80H138N26O24S2; CAS# [150469-23-1] net

Prion Protein (106-126) (human) (scrambled)
H-4882.1000	Bachem	1.0mg	EUR 418
Description: Sum Formula: C80H138N26O24S2; CAS# [150469-23-1] net

3-D Life Scrambled RGD Peptide
P11-3	Cellendes	3x 1 µmol	EUR 276

Adenovirus protein (Mouse)
30-1268	Fitzgerald	1 mg	EUR 241
Description: Purified native Adenovirus protein (Mouse)

Adenovirus E1A antibody
20-ES02	Fitzgerald	100 ug	EUR 219
Description: Sheep polyclonal Adenovirus E1A antibody

Adenovirus antibody (biotin)
60C-CR1238GB	Fitzgerald	1 ml	EUR 363
Description: Goat polyclonal Adenovirus antibody (biotin) conjugated

Adenovirus antibody (FITC)
60C-CR1238GF	Fitzgerald	1 ml	EUR 363
Description: Goat polyclonal Adenovirus antibody (FITC) conjugated

Adenovirus antibody (FITC)
61-A02A	Fitzgerald	100 ug	EUR 358
Description: Mouse monoclonal Adenovirus antibody (FITC)

Adenovirus antibody (FITC)
60-A01	Fitzgerald	1 ml	EUR 367
Description: Goat polyclonal Adenovirus antibody (FITC) conjugated

Adenovirus antibody (HRP)
60-A02	Fitzgerald	1 ml	EUR 412
Description: Goat polyclonal Adenovirus antibody (HRP) conjugated

RFP expression Adenovirus
AVP001	GenTarget	1x109 IFU/ml x 200ul	EUR 349
Description: pre-made RFP expression adenovirus, provided in DMEM medium.

CFP expression Adenovirus
AVP002	GenTarget	1x109 IFU/ml x 200ul	EUR 349
Description: pre-made CFP expression adenovirus, provided in DMEM medium.

Luciferase / GFP Adenovirus
AVP004	GenTarget	1x109 IFU/ml x 200ul	EUR 349
Description: pre-made Luciferase / GFP expression adenovirus, provided in DMEM medium.

Luciferase / RFP Adenovirus
AVP005	GenTarget	1x109 IFU/ml x 200ul	EUR 349
Description: pre-made Luciferase / RFP expression adenovirus, provided in DMEM medium.

CRISPR / hCas9 Adenovirus
AVP010	GenTarget	1x109 IFU/ml x 200ul	EUR 451
Description: pre-made adenovirus expresses the neclear penetrated, human codon optimized wild-type Cas9 endonuclease, provided in DMEM medium.

GFP expression Adenovirus
AVP011	GenTarget	1x109 IFU/ml x 200ul	EUR 349
Description: pre-made GFP expression adenovirus, provided in DMEM medium.

YFP expression Adenovirus
AVP012	GenTarget	1x109 IFU/ml x 200ul	EUR 349
Description: pre-made YFP expression adenovirus, provided in DMEM medium.

BFP expression Adenovirus
AVP017	GenTarget	1x109 IFU/ml x 200ul	EUR 349
Description: pre-made BFP expression adenovirus, provided in DMEM medium.

Adenovirus Antibody (FITC)
abx022914-1ml	Abbexa	1 ml	EUR 648
Shipped within 5-10 working days.

Adenovirus Hexon Antibody
abx023633-1mg	Abbexa	1 mg	EUR 662
Shipped within 5-10 working days.

Adenovirus Hexon Antibody
abx023661-1mg	Abbexa	1 mg	EUR 599
Shipped within 5-10 working days.

Adenovirus Hexon Antibody
abx023662-1mg	Abbexa	1 mg	EUR 599
Shipped within 5-10 working days.

Adenovirus Hexon Antibody
abx023854-1mg	Abbexa	1 mg	EUR 599
Shipped within 5-10 working days.

Adenovirus Hexon Antibody
abx023856-1mg	Abbexa	1 mg	EUR 599
Shipped within 5-10 working days.

Adenovirus Hexon Antibody
abx023857-1mg	Abbexa	1 mg	EUR 599
Shipped within 5-10 working days.

Adenovirus Hexon Antibody
abx023858-1mg	Abbexa	1 mg	EUR 599
Shipped within 5-10 working days.

Adenovirus Hexon Antibody
abx023872-1mg	Abbexa	1 mg	EUR 599
Shipped within 5-10 working days.

Adenovirus Hexon Antibody
abx024001-1mg	Abbexa	1 mg	EUR 1010
Shipped within 5-10 working days.

Adenovirus Hexon Antibody
abx024002-1mg	Abbexa	1 mg	EUR 1010
Shipped within 5-10 working days.

Adenovirus Hexon Antibody
abx024003-1mg	Abbexa	1 mg	EUR 1010
Shipped within 5-10 working days.

Adenovirus Antibody (FITC)
abx021508-1mg	Abbexa	1 mg	EUR 1247
Shipped within 5-10 working days.

Adenovirus Hexon Antibody
abx021514-1mg	Abbexa	1 mg	EUR 843
Shipped within 5-10 working days.

Adenovirus Hexon Antibody
abx021516-1mg	Abbexa	1 mg	EUR 843
Shipped within 5-10 working days.

Adenovirus Hexon Antibody
abx021518-1mg	Abbexa	1 mg	EUR 1017
Shipped within 5-10 working days.

Adenovirus Hexon Antibody
abx021519-1mg	Abbexa	1 mg	EUR 926
Shipped within 5-10 working days.

Adenovirus Hexon Antibody
abx021520-1mg	Abbexa	1 mg	EUR 732
Shipped within 5-10 working days.

Adenovirus Hexon Antibody
abx021523-1mg	Abbexa	1 mg	EUR 732
Shipped within 5-10 working days.

Adenovirus Hexon Antibody
abx021525-1mg	Abbexa	1 mg	EUR 732
Shipped within 5-10 working days.

Adenovirus Hexon Antibody
abx120000-1mg	Abbexa	1 mg	EUR 599
Shipped within 5-10 working days.

Adenovirus Hexon Antibody
abx120001-1mg	Abbexa	1 mg	EUR 599
Shipped within 5-10 working days.

Adenovirus Hexon Antibody
abx120002-1mg	Abbexa	1 mg	EUR 599
Shipped within 5-10 working days.

Adenovirus Hexon Antibody
abx120003-1mg	Abbexa	1 mg	EUR 599
Shipped within 5-10 working days.

Adenovirus Hexon Antibody
abx120004-1mg	Abbexa	1 mg	EUR 599
Shipped within 5-10 working days.

Adenovirus Hexon Antibody
abx120005-1mg	Abbexa	1 mg	EUR 599
Shipped within 5-10 working days.

Adenovirus Hexon Antibody
abx120006-1mg	Abbexa	1 mg	EUR 599
Shipped within 5-10 working days.

Adenovirus Hexon Antibody
abx120007-1mg	Abbexa	1 mg	EUR 599
Shipped within 5-10 working days.

?-Galalactosidase Recombinant Adenovirus
ADV-002	Cell Biolabs	50 ?L	EUR 891
Description: Premade recombinant adenovirus containing the beta-galactosidase gene

GFP Recombinant Adenovirus
ADV-004	Cell Biolabs	50 ?L	EUR 891
Description: Premade recombinant adenovirus containing the GFP gene

Cre Recombinant Adenovirus
ADV-005	Cell Biolabs	50 ?L	EUR 891
Description: Premade recombinant adenovirus containing the Cre gene

Rac1 Recombinant Adenovirus
ADV-149	Cell Biolabs	50 ?L	EUR 891
Description: Premade recombinant adenovirus containing the Rac1 gene

Cdc42 Recombinant Adenovirus
ADV-152	Cell Biolabs	50 ?L	EUR 891
Description: Premade recombinant adenovirus containing the Cdc42 gene

Adenovirus (ADV) Antibody
abx411041-1ml	Abbexa	1 ml	EUR 509
Shipped within 1 week.

Przedstawiamy obraz z rozdzielczością czasową około 100 białek (2D-PAGE i proteomika strzelby) i 200 metabolitów, które są obecne podczas przejścia od wzrostu planktonu do tworzenia biofilmu w społeczności. Białka biorące udział w odpowiedzi na stres, naprawie uszkodzeń DNA i transporcie okazały się silnie wyrażane w stanie biofilmu. Ponadto metabolity wykryte w biofilmach odpowiadają składnikom macierzy egzopolisacharydów (EPS) (cukry i glicerol). Zmianom enzymów metabolicznych towarzyszyły wyraźniejsze zmiany stężenia półproduktów ze szlaku glikolizy, a także kilku aminokwasów.